Peptídeos podem ser analisados pelo tratamento com duas enzimas. Uma delas, uma carboxipeptidase, quebra mais rapidamente a ligação peptídica entre o aminoácido que tem um grupo carboxílico livre e o seguinte. O tratamento com outra enzima,uma aminopeptidase, quebra, mais rapidamente, a ligação peptídica entre o aminoácido que tem um grupo amino livre e o anterior. Isso permite identificar a sequência dos aminoácidos no peptídeo.
Um tripeptídeo, formado pelos aminoácidos lisina, fenilalanina e glicina, não necessariamente nessa ordem, foi submetido a tratamento com carboxipeptidase, resultando em uma mistura de um dipeptídeo e fenilalanina. O tratamento do mesmo tripeptídeo com aminopeptidase resultou em uma mistura de um outro dipeptídeo e glicina.
O número de combinações possíveis para os três aminoácidos e a fórmula estrutural do peptídeo podem ser, respectivamente,
- a
- b
- c
- d
- e
O Tripeptídeo é formado pela combinação dos três aminoácidos: lisina (Lys), fenilalamina (Phe) e glicina(Gly). Dessa forma, existem 6 combinações possíveis para esse tripeptídeo. São elas:
| Lys – Phe – Gly | Phe – Lys – Gly | Gly – Phe – Lys |
| Lys – Gly – Phe | Phe – Gly – Lys | Gly – Lys- Phe |
O tripeptídeo submetido ao tratamento citado no texto apresenta carboxila livre da fenilalanina e amino livre da glicina. Sendo assim, a estrutura da tripeptídeo é:
