A hematoxilina (H&E) é um corante de caráter básico que reage com substâncias ácidas ou estruturas que tenham caráter ácido existentes nas células. O resultado dessa reação cora a estrutura celular de azul-arroxeado. Uma lâmina de microscopia com células da mucosa bucal, caso entre em contato com a hematoxilina (H&E), irá corar de azul-arroxeado
O núcleo é rico em ácidos nucleicos (DNA e RNA), que reagem com o corante hematoxilina. Os outros componentes celulares citados não apresentam ácidos e não são corados pela hematoxilina.